Pengaruh selisih jarak COM terhadap perubahan energi bebas MIP-rapamycin menggunakan kecepatan tarikan 0,005 nm ps-1 dengan metode umbrella sampling

Jelimalini, Jelimalini (2025) Pengaruh selisih jarak COM terhadap perubahan energi bebas MIP-rapamycin menggunakan kecepatan tarikan 0,005 nm ps-1 dengan metode umbrella sampling. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

Preview	Text (ABSTRAK) ABSTRAK.pdf Download (943kB) | Preview
Preview	Text (BAB 1) BAB 1.pdf Download (578kB) | Preview
	Text (BAB 2) BAB 2.pdf Restricted to Registered users only Download (631kB) | Request a copy
	Text (BAB 3) BAB 3.pdf Restricted to Registered users only Download (332kB) | Request a copy
	Text (BAB 4) BAB 4.pdf Restricted to Registered users only Download (547kB) | Request a copy
Preview	Text (BAB 5) BAB 5.pdf Download (335kB) | Preview

Abstract

MIP (Microphage Infectivity Potentior) merupakan keluarga protein FK506 binding protein (FKBP) yang memiliki aktivitas PPIase (Peptidyl prolyl cis-trans isomerase). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bagaimana selisih jarak COM dan kecepatan tarikan mempengaruhi perhitungan ∆G pada pengikatan MIP-Rapamycin menggunakan metode umbrella sampling. Umbrella Sampling merupakan metode pengambilan sampel yang dilakukan sepanjang koordinat reaksi yang dipilih. Sehingga kita dapat memperkirakan energi bebas relatif dari berbagai keadaan disepanjang koordinat reaksi. Pada penelitian ini menggunakan kecepatan tarikan 0,005 nm ps-1 dengan empat variasi selisih jarak COM diperoleh hasil perhitungan perubahan energi bebas masing-masing (A) -38,803 kJ/mol, (B) -28,449 kJ/mol, (C) -48,531 kJ/mol, dan (D) -52,736 kJ/mol. Selisih jarak COM dari empat variasi menggunakan kecepatan tarikan dikurangi menjadi 0,005 nm ps-1 semuanya menunjukkan adanya celah. Celah kecil menyebabkan perhitungan perubahan energi bebas menjadi naik, berbeda bila terdapat celah besar perhitungan perubahan energi bebas menjadi turun.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Department:	S1 - Farmasi
Contributors:	Contribution Contributors NIDN / NIDK Email Thesis advisor Widjajakusuma, Elisabeth Catherina NIDN0705047401 ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords:	MIP, rapamycin, perhitungan perubahan energi bebas (∆G), umbrella sampling, selisih jarak COM.
Subjects:	Pharmacy
Divisions:	Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User:	JELIMALINI JELIMALINI
Date Deposited:	19 Jan 2026 06:56
Last Modified:	19 Jan 2026 06:56
URI:	https://repositori.ukwms.ac.id/id/eprint/45778

Actions (login required)

View Item