Pengaruh pemilihan jumlah trayektori terhadap perubahan energi bebas pengikatan mip-s35dt dengan metode umbrella sampling

Kusumastuti, Bernadetta Esti (2025) Pengaruh pemilihan jumlah trayektori terhadap perubahan energi bebas pengikatan mip-s35dt dengan metode umbrella sampling. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

Preview	Text (ABSTRAK) ABSTRAK.pdf Download (900kB) | Preview
Preview	Text (BAB 1) BAB 1.pdf Download (297kB) | Preview
	Text (BAB 2) BAB 2.pdf Restricted to Registered users only Download (750kB) | Request a copy
	Text (BAB 3) BAB 3.pdf Restricted to Registered users only Download (417kB) | Request a copy
	Text (BAB 4) BAB 4.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) | Request a copy
Preview	Text (BAB 5) FIX BAB 5 BERNADETTA FARMASI.pdf Download (404kB) | Preview

Abstract

Macrophage infectivity potentiator (Mip) adalah salah satu faktor virulensi dari beberapa bakteri Gram negatif, salah satunya adalah bakteri Legionella pneumophila, yang berperan dalam patogenesis penyakit Legionnaires. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas ligan turunan sikloheksimida dengan substituen 3,5 dimetiladamantan (s35dt); dalam hal ini gugus adamantan menjauhi rongga pengikatan. Parameter afinitas ligan s35dt adalah perubahan energi bebas. Metode yang digunakan adalah metode Umbrella Sampling (US), yaitu teknik untuk menghitung energi rata-rata di sepanjang koordinat reaksi dengan tiga variasi jumlah trayektori, yaitu 35, 40 dan 45. Hasil penelitian ini diperoleh hasil masing-masing pada jumlah trayektori 35 sebesar -15,3144 kJ/mol, jumlah trayektori 40 sebesar -15,3216 kJ/mol dan jumlah trayektori 45 sebesar -15,353 kJ/mol. Kesimpulan bahwa semakin meningkat jumlah trayektori, maka perubahan energi bebas akan semakin menurun, pada trayetori 35 dan 40 terjadi penurunan sebesar -0,0470%, sedangkan pada trayektori 40 dan 45 terjadi penurunan sebesar -0,2049%.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Department:	S1 - Farmasi
Contributors:	Contribution Contributors NIDN / NIDK Email Thesis advisor Widjajakusuma, E. Catherina NIDN0705047401 ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords:	Mip, legionella pneumophila, sikloheksimida, energi bebas, umbrella sampling (US).
Subjects:	Pharmacy
Divisions:	Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User:	Bernadetta Esti Kusumastuti
Date Deposited:	10 Jul 2025 02:50
Last Modified:	10 Jul 2025 02:50
URI:	https://repositori.ukwms.ac.id/id/eprint/43486

Actions (login required)

View Item