Pengaruh pemilihan jarak Trayektori antara Protein Rapamycin terhadap perubahan energi bebas pengikatan dengan metode umbrella sampling

Dewi, Putri Juliana (2024) Pengaruh pemilihan jarak Trayektori antara Protein Rapamycin terhadap perubahan energi bebas pengikatan dengan metode umbrella sampling. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

[thumbnail of ABSTRAK] Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf
Download (595kB)
[thumbnail of BAB 1] Text (BAB 1)
BAB 1.pdf
Download (120kB)
[thumbnail of BAB 2] Text (BAB 2)
BAB 2.pdf
Restricted to Registered users only
Download (333kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 3] Text (BAB 3)
BAB 3.pdf
Restricted to Registered users only
Download (124kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 4] Text (BAB 4)
BAB 4.pdf
Restricted to Registered users only
Download (275kB) | Request a copy
[thumbnail of BAB 5] Text (BAB 5)
BAB 5.pdf
Download (167kB)

Abstract

Legionnaires’ disease merupakan penyakit yang disebabkan oleh bakteri Gram negatif yaitu Legionella pneumophila. Bakteri Legionella pneumophila memiliki protein macrophage infectivity potentiator (MIP), sebagai suatu faktor virulensi utama. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui seberapa besar afinitas pengikatan antara ligan rapamycin dan protein MIP, diperlukan perhitungan perubahan energi bebas.Metode US (Umbrella Sampling) adalah teknik yang digunakan untuk memperoleh profil energi bebas melalui mengambilan sampel konformasi yang ditingkatkan sepanjang koordinat reaksi. Pada penelitian ini diperoleh hasil perhitungan ΔG masing-masing (A) -39,234 kJ/mol, (B) -37,833 kJ/mol, (C) -45,817 kJ/mol, dan (D) -32,653 kJ/mol. Hasil penelitian menunjukkan semakin menurun selisih jarak maka celah akan semakin bertambah ini menyebabkan penurunan perubahan energi bebas.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: S1 - Farmasi
Contributors:
Contribution
Contributors
NIDN / NIDK
Email
Thesis advisor
Widjajakusuma, Elisabeth Catherina
NIDN0705047401
ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords: MIP, Rapamycin, Perhitungan perubahan Energi Bebas, US (Umbrella Sampling), Simulasi Dinamika Molekul.
Subjects: Pharmacy
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: Putri Julianadewi
Date Deposited: 14 Jan 2025 07:12
Last Modified: 14 Jan 2025 07:12
URI: https://repositori.ukwms.ac.id/id/eprint/41851

Actions (login required)

View Item View Item