Pengaruh pemilihan jarak trayektori hasil simulasi dinamika molekul terhadap perubahan energi bebas pengikatan protein fkbp12 - rapamycin dengan metode umbrella sampling

Lorensa, Dilla (2024) Pengaruh pemilihan jarak trayektori hasil simulasi dinamika molekul terhadap perubahan energi bebas pengikatan protein fkbp12 - rapamycin dengan metode umbrella sampling. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

[thumbnail of ABSTRAK] Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf
Download (620kB)
[thumbnail of BAB 1] Text (BAB 1)
BAB 1.pdf
Download (242kB)
[thumbnail of BAB 2] Text (BAB 2)
BAB 2.pdf
Restricted to Registered users only
Download (549kB)
[thumbnail of BAB 3] Text (BAB 3)
BAB 3.pdf
Restricted to Registered users only
Download (177kB)
[thumbnail of BAB 4] Text (BAB 4)
BAB 4.pdf
Restricted to Registered users only
Download (471kB)
[thumbnail of BAB 5] Text (BAB 5)
BAB 5.pdf
Download (393kB)

Abstract

Legionnaires’ disease merupakan suatu penyakit yang disebabkan oleh bakteri Legionella pneumophila. Salah satu faktor virulensi utama bakteri ini adalah protein MIP (Macrophage Infectivity Potentiator), MIP juga memiliki struktur yang mirip dengan FKBP12 karena itu kedua protein berinteraksi dengan inhibitor FK506 dan Rapamycin dengan cara yang sama. enelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pemilihan selisih jarak COM terhadap perhitungan ∆G. Metode US (Umbrella Sampling) adalah teknik yang digunakan untuk memperoleh profil energi bebas melalui pengambilan sampel konformasi yang ditingkatkan sepanjang koordinat reaksi. Pada penelitian ini diperoleh hasil perhitungan ∆G masing-masing (A) -59,259 kJ/mol, (B) -68,268 kJ/mol, (C) -74,27 kJ/mol, dan (D) -55,354 kJ/mol. Hasil penelitian menunjukan semakin meningkat selisih jarak maka celah akan semakin bertambah ini menyebabkan penurunan perubahan energi bebas.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Department: S1 - Farmasi
Contributors:
Contribution
Contributors
NIDN / NIDK
Email
Thesis advisor
Widjajakusuma, Elisabeth Catherina
NIDN0705047401
ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords: FKBP12, Rapamycin, perhitungan perubahan energi bebas, US (Umbrella Sampling), simulasi dinamika molekul
Subjects: Pharmacy
Divisions: Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User: Users 14673 not found.
Date Deposited: 13 Jan 2025 08:54
Last Modified: 14 Jan 2025 06:37
URI: https://repositori.ukwms.ac.id/id/eprint/41847

Actions (login required)

View Item View Item