Pengaruh selisih jarak COM terhadap ΔG pengikatan FKBP12-rapamycin dengan metode umbrella sampling selama 950 ns

Zahro, Irvania Tyas (2026) Pengaruh selisih jarak COM terhadap ΔG pengikatan FKBP12-rapamycin dengan metode umbrella sampling selama 950 ns. Undergraduate thesis, Widya Mandala Surabaya Catholic University.

Preview	Text (ABSTRAK) ABSTRAK.pdf Download (801kB) | Preview
Preview	Text (BAB 1) BAB 1.pdf Download (300kB) | Preview
	Text (BAB 2) BAB 2.pdf Restricted to Registered users only Download (609kB) | Request a copy
	Text (BAB 3) BAB 3.pdf Restricted to Registered users only Download (305kB) | Request a copy
	Text (BAB 4) BAB 4.pdf Restricted to Registered users only Download (909kB) | Request a copy
Preview	Text (BAB 5) BAB 5.pdf Download (306kB) | Preview

Abstract

Rapamycin merupakan senyawa inhibitor yang efektif terhadap protein MIP. Namun Rapamycin juga dapat membentuk kompleks dengan FKBP12 pada manusia, dan menyebabkan efek imunosupresif. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh selisih jarak COM terhadap perhitungan perubahan energi bebas (ΔG) untuk kompleks FKBP12 Rapamycin. Nilai ΔG akan digunakan untuk menentukan afinitas antara protein FKBP12 dan ligan Rapamycin. Metode umbrella sampling digunakan untuk mendapatkan sampel di sepanjang koordinat reaksi sehingga diperoleh profil energi bebas. Penelitian ini menggunakan kecepatan tarikan 0,01 nm ps-1 dengan empat variasi selisih jarak COM, diperoleh nilai ΔG (A) -64,811 kJ/mol, (B) -58,892 kJ/mol, (C) -65,588 kJ/mol, dan (D) -57,543 kJ/mol. Celah terkecil pada variasi (A) dengan jarak celah 0,014 nm, dan celah terbesar pada variasi (D) dengan jarak celah pertama 0,148 dan jarak celah kedua 0,116 nm.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Department:	S1 - Farmasi
Contributors:	Contribution Contributors NIDN / NIDK Email Thesis advisor Widjajakusuma, Elisabeth Catherina NIDN0705047401 ecwidj@ukwms.ac.id
Uncontrolled Keywords:	Rapamycin, FKBP12, perhitungan perubahan energi bebas, umbrella sampling, selisih jarak COM
Subjects:	Pharmacy
Divisions:	Faculty of Pharmacy > Pharmacy Study Program
Depositing User:	Irvania Tyas Zahro
Date Deposited:	13 Jul 2026 04:21
Last Modified:	13 Jul 2026 04:21
URI:	https://repositori.ukwms.ac.id/id/eprint/46935

Actions (login required)

View Item